اهداف مرکز مطالعات به شرح زیر است:
گروه پژوهشی «مطالعات فرهنگی»
مأموریت: مطالعه و پژوهش درباره مؤلفه‌ها و عناصر فرهنگی و اجتماعی مردمان کشورهای وارث تمدن ایرانی و شناسایی ظرفیت‌ها و فرصت‌ها و تحدیدها و آسیب‌های موجود در این حوزه.
اهداف:
1- واکاوی تجربه‌های موفق اتحاد و انسجام اقوام در هر یک از کشورهای وارث تمدن ایرانی؛
2- پژوهش درباره میراث معنوی مشترک مبتنی بر فرهنگ و تمدن ایرانی در کشورهای مورد نظر؛
3- شناخت و معرفی میراث فرهنگی ملموس و آثار باستانی گردشگری هر یک از کشورهای وارث تمدن ایرانی.
گروه پژوهشی مطالعات سیاسی
مأموریت: مطالعه و پژوهش درباره مؤلفه‌ها، عناصر و رفتارهای سیاسی مردم، احزاب و نظام‌های سیاسی هر یک از کشورهای وارث تمدن ایرانی و شناسایی ظرفیت‌ها و فرصت‌های همگرایی منطقه‌ای و تهدیدها و آسیب‌های موجود در این حوزه.
اهداف:
1- پژوهش و تحقیق درباره ماهیت حکومت و سیاست در هر یک از کشورها در دهه‌های اخیر؛
2- شناخت اهداف استراتژیک منافع ملی هر یک از کشورها و سناریوهای دستیابی به آن و زمینه‌های مشترک همکاری؛
3- پژوهش درباره اهداف گروه‌های افراط‌گرا در هر یک از کشورهای وارث تمدن ایرانی؛ به‌ویژه در قبال جمهوری اسلامی ایران.