گروههای پژوهشی بنا بر اساسنامه ابلاغی وزارت علوم، تحقیقات و فناوری، مرکز پژوهشی مطالعات وارث تمدن ایرانی با تشکیل دو گروه پژوهشی زیر که تحت نظر شورای پژوهشی مرکز فعالیت میکنند، تأسیس شده است: 1- گروه پژوهشی مطالعات فرهنگی؛ 2- گروه پژوهشی مطالعات سیاسی.